L'histoire en quelques lignes...
En essayant encore et toujours d'enterrer son gland, Scrat active accidentellement une soucoupe volante prise dans la glace qui l'emmène dans l'espace, où il met en place le système solaire et envoie involontairement un énorme astéroïde en direction de la Terre.
Pendant ce temps, Pêche va se marier avec son fiancé, Julian, un jeune mammouth maladroit, irréfléchi et un peu bête, ce qui ne plaît pas à Manny. Diego et Kira veulent fonder une famille, mais leur apparence féroce a tendance à effrayer les enfants. Sid est largué par sa petite amie, Francine, alors qu'il est sur le point de lui proposer de se marier, et essaie de trouver du réconfort auprès de ses amis.
Plus tard, pendant la fête d'anniversaire de mariage de Manny et Ellie (que Manny a oublié) durant lequel ils apprennent que Pêche et Julian prévoient de voyager après leur mariage, des astéroïdes frappent l'endroit, le groupe et le troupeau échappe de justesse à l'incident, le groupe trouve refuge dans une caverne.
Les animaux comprennent qu'ils sont en danger. Ils doivent alors tout faire pour éviter leur extinction.